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河北医科大学研究生教育始于1964年，首次招收硕士研究生两名，后因故停招。1978年恢复招生。1981年，国家颁布《中华人民共和国学位条例》，标志着新中国学位制度正式确立。同年，我校被国务院学位委员会批准为首批硕士学位授予单位，建立12个硕士学位授权点。

1986年被国务院学位委员会批准为博士学位授予单位，生理学博士学位授权点成为河北省第一个自然科学博士学位授权点。1987年开始招收博士研究生。1996年被批准为同等学力人员申请硕士学位授权单位，1998年被批准为临床医学硕士专业学位试点单位，2000年被批准为临床医学博士专业学位授权单位，2001年被批准为在职医师申请临床医学博士专业学位授权单位。

随着研究生教育的发展，在校人数的增加，在不同时期设置了相应的研究生管理机构。五十多年来，研究生教育管理机构的设置经历了河北医学院教务处、科研处研究生科、研究生部等几个主要阶段。2001年，成立研究生学院。