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南京工业大学是首批入选国家“高等学校创新能力提升计划”（2011计划）高校，是江苏高水平大学建设高峰计划a类建设高校、江苏省重点建设高校、江苏省综合改革试点高校、江苏省人才强校试点高校、国家首批深化创新创业教育改革示范高校、全国高校实践育人创新创业基地、教育部首批卓越工程师培养计划试点高校、专业学位研究生教育综合改革试点高校、教育部国防教育特色学校、江苏省落实“科技创新改革30条”试点高校。

学校研究生教育紧紧抓住国家研究生教育改革与发展的战略机遇，围绕学校建成国内一流国际知名创业型大学的发展目标，加速提升高层次创新人才培养能力，全面提高研究生培养质量，形成了产学研协同创新的鲜明特色。近年来，学校探索实施研究生培养“163工程”，即以“立德树人、服务需求、提高质量、追求卓越”为“一条主线”，实施生源质量提升、国际交流推进、百名名师名导、导师能力培育、创新创业发展、学术氛围增进“六大发展计划”，构建研究生培养过程保障、思政教育管理、成果产出考评“三大支撑体系”，不断深化研究生教育改革。