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学校现有24个学院,1个教学部。7个博士后流动站,8个一级学科博士学位授权点(水利工程、农业工程、作物学、园艺学、畜牧学、兽医学、草学、农林经济管理),19个一级学科硕士学位授权点,14个硕士专业学位授权点,63个本科专业,分布在农、理、工、经、管、文、法等7个学科门类中。学校积极参与教育部“双万计划”,现有15个国家级一流本科专业建设点,12个自治区级一流本科专业建设点,3门国家级一流课程,28门自治区级一流课程。围绕现代农牧业、特色林果业等领域建有国家级重点学科1个(草业科学),国家重点(培育)学科1个(水利水电工程),国家林业和草原局重点学科3个(森林培育学、林学、农业资源与环境),国家林业和草原局重点培育学科2个(生态学、果树学),自治区“十四五”高等学校院士支持计划依托学科1个(水利工程),自治区“十四五”优势学科1个(畜牧学),自治区“十四五”特色学科5个(草学、兽医学、作物学、农业工程、农业资源与环境)。植物与动物科学学科进入esi全球排名前1%。拥有棉花教育部工程研究中心、新疆现代奶业工程技术研究中心、新疆草地资源与生态实验室、新疆果品加工与保鲜工程技术研究中心等省部级研究中心、重点实验室25个。(数据更新时间:2022年9月)